Скелет ящірки складається з трьох відділів: скелета голови, осьового скелета, скелета кінцівок.
Скелет голови плазунів представлений черепною коробкою, де міститься головний мозок, та вісцеральним відділом. Череп плазунів майже повністю кістковий.
У ящірки шийних хребців 8 - вони забезпечують рухомість голови. Особливість шийного відділу хребта плазунів — своєрідна будова двох перших хребців. Перший шийний хребець має вид кільця, в яке заходить зубоподібний відросток другого шийного хребця. Таким чином, перший хребець (що зчленовується з черепом) може вільно обертатися навкруги зубоподібного відростка другого хребця, що забезпечує велику рухливість голови. Така будова двох перших шийних хребців зберігається у всіх подальших класів хребетних.
Усі хребці попереково-грудного відділу мають ребра. Ребра перших п’яти хребців приєднуються до грудини за допомогою хряща, утворюючи грудну клітку (грудина і грудна клітина відсутня у змій). Так утворюється грудна клітка, що оберігає легені й серце тварини.
Крижовий відділ складається з двох хребців, до поперечних відростків яких причленяються клубові кістки.
Парні кінцівки плазунів зберігають загальну схему будови кінцівок наземних хребетних: перетинки між пальцями відсутні, на пальцях є кігті.
Щодо скелета передніх кінцівок плазунів слід звернути увагу на видовженість плеча і передпліччя (ліктьова і променева кістки) та вкорочення кісток кисті порівняно із земноводними.
Скелет задніх кінцівок плазунів складається із кісток стегна, гомілки (велика і мала гомілкові) та стопи.
У рептилій міцніше причленування тазового пояса (сідничні, лобкові та клубові кістки) до осьового скелета порівняно із земноводними.